Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms