Protein–RNA interactions for Protein: P41241

Csk, Tyrosine-protein kinase CSK, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CskP41241 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CskP41241 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CskP41241 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CskP41241 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CskP41241 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CskP41241 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CskP41241 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CskP41241 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CskP41241 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CskP41241 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CskP41241 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CskP41241 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CskP41241 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CskP41241 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CskP41241 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CskP41241 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CskP41241 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CskP41241 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CskP41241 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CskP41241 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CskP41241 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CskP41241 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CskP41241 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CskP41241 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CskP41241 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CskP41241 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CskP41241 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CskP41241 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CskP41241 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CskP41241 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CskP41241 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CskP41241 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CskP41241 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CskP41241 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CskP41241 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CskP41241 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CskP41241 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CskP41241 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CskP41241 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CskP41241 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CskP41241 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CskP41241 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CskP41241 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CskP41241 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CskP41241 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CskP41241 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CskP41241 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CskP41241 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CskP41241 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CskP41241 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CskP41241 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CskP41241 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CskP41241 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CskP41241 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CskP41241 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CskP41241 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CskP41241 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CskP41241 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CskP41241 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CskP41241 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CskP41241 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CskP41241 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CskP41241 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CskP41241 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CskP41241 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CskP41241 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CskP41241 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CskP41241 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CskP41241 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CskP41241 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CskP41241 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CskP41241 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CskP41241 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CskP41241 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CskP41241 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CskP41241 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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