Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
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