Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6dP35459 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms