Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rab5cP35278 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rab5cP35278 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rab5cP35278 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rab5cP35278 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rab5cP35278 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rab5cP35278 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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