Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp4P35123 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp4P35123 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp4P35123 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp4P35123 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp4P35123 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp4P35123 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp4P35123 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp4P35123 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp4P35123 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp4P35123 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp4P35123 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp4P35123 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp4P35123 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp4P35123 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp4P35123 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp4P35123 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp4P35123 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp4P35123 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp4P35123 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp4P35123 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp4P35123 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp4P35123 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp4P35123 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp4P35123 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp4P35123 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp4P35123 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp4P35123 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp4P35123 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp4P35123 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp4P35123 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp4P35123 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp4P35123 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp4P35123 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp4P35123 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp4P35123 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp4P35123 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp4P35123 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp4P35123 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp4P35123 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp4P35123 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp4P35123 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp4P35123 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp4P35123 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp4P35123 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp4P35123 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp4P35123 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp4P35123 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp4P35123 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp4P35123 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp4P35123 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp4P35123 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp4P35123 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp4P35123 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp4P35123 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp4P35123 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms