Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms