Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SsbP32067 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SsbP32067 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SsbP32067 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SsbP32067 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SsbP32067 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SsbP32067 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SsbP32067 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SsbP32067 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SsbP32067 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SsbP32067 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SsbP32067 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SsbP32067 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SsbP32067 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SsbP32067 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SsbP32067 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SsbP32067 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SsbP32067 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SsbP32067 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SsbP32067 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SsbP32067 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SsbP32067 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SsbP32067 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SsbP32067 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SsbP32067 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SsbP32067 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SsbP32067 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SsbP32067 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SsbP32067 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SsbP32067 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SsbP32067 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SsbP32067 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SsbP32067 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SsbP32067 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SsbP32067 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SsbP32067 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SsbP32067 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SsbP32067 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SsbP32067 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SsbP32067 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SsbP32067 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SsbP32067 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SsbP32067 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SsbP32067 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SsbP32067 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SsbP32067 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SsbP32067 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SsbP32067 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SsbP32067 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SsbP32067 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SsbP32067 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SsbP32067 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SsbP32067 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SsbP32067 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SsbP32067 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SsbP32067 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SsbP32067 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SsbP32067 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SsbP32067 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SsbP32067 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SsbP32067 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SsbP32067 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SsbP32067 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SsbP32067 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SsbP32067 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SsbP32067 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SsbP32067 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SsbP32067 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SsbP32067 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SsbP32067 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SsbP32067 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SsbP32067 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SsbP32067 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SsbP32067 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SsbP32067 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SsbP32067 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SsbP32067 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SsbP32067 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SsbP32067 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SsbP32067 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SsbP32067 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SsbP32067 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SsbP32067 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SsbP32067 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SsbP32067 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SsbP32067 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SsbP32067 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SsbP32067 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SsbP32067 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SsbP32067 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SsbP32067 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SsbP32067 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SsbP32067 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SsbP32067 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SsbP32067 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SsbP32067 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SsbP32067 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SsbP32067 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SsbP32067 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SsbP32067 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms