Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Saa4P31532 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Saa4P31532 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Saa4P31532 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Saa4P31532 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Saa4P31532 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Saa4P31532 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms