Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms