Protein–RNA interactions for Protein: P29037

Tbp, TATA-box-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbpP29037 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TbpP29037 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TbpP29037 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
TbpP29037 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
TbpP29037 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TbpP29037 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TbpP29037 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TbpP29037 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TbpP29037 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TbpP29037 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TbpP29037 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TbpP29037 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TbpP29037 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TbpP29037 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TbpP29037 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms