Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn10P28658 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms