Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CftrP26361 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CftrP26361 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CftrP26361 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CftrP26361 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CftrP26361 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CftrP26361 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CftrP26361 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CftrP26361 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CftrP26361 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CftrP26361 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CftrP26361 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CftrP26361 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CftrP26361 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CftrP26361 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CftrP26361 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CftrP26361 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CftrP26361 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CftrP26361 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CftrP26361 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CftrP26361 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CftrP26361 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CftrP26361 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CftrP26361 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CftrP26361 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CftrP26361 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CftrP26361 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CftrP26361 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CftrP26361 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CftrP26361 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CftrP26361 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CftrP26361 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CftrP26361 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CftrP26361 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CftrP26361 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CftrP26361 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CftrP26361 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CftrP26361 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CftrP26361 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CftrP26361 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CftrP26361 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CftrP26361 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CftrP26361 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CftrP26361 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CftrP26361 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CftrP26361 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CftrP26361 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CftrP26361 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CftrP26361 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CftrP26361 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CftrP26361 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CftrP26361 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CftrP26361 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CftrP26361 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CftrP26361 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CftrP26361 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CftrP26361 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CftrP26361 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CftrP26361 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CftrP26361 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CftrP26361 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CftrP26361 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CftrP26361 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CftrP26361 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CftrP26361 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CftrP26361 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CftrP26361 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CftrP26361 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CftrP26361 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CftrP26361 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CftrP26361 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CftrP26361 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CftrP26361 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CftrP26361 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CftrP26361 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CftrP26361 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CftrP26361 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CftrP26361 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CftrP26361 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CftrP26361 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CftrP26361 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CftrP26361 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CftrP26361 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CftrP26361 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CftrP26361 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CftrP26361 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CftrP26361 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CftrP26361 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CftrP26361 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CftrP26361 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CftrP26361 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CftrP26361 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CftrP26361 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CftrP26361 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CftrP26361 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CftrP26361 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CftrP26361 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CftrP26361 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CftrP26361 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CftrP26361 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms