Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChgaP26339 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ChgaP26339 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChgaP26339 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChgaP26339 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChgaP26339 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChgaP26339 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChgaP26339 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ChgaP26339 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ChgaP26339 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChgaP26339 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChgaP26339 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms