Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms