Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms