Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsta3P23591 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsta3P23591 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsta3P23591 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsta3P23591 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsta3P23591 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsta3P23591 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsta3P23591 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsta3P23591 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsta3P23591 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tsta3P23591 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tsta3P23591 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tsta3P23591 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tsta3P23591 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsta3P23591 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tsta3P23591 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tsta3P23591 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsta3P23591 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tsta3P23591 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tsta3P23591 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsta3P23591 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tsta3P23591 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsta3P23591 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsta3P23591 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsta3P23591 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tsta3P23591 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tsta3P23591 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tsta3P23591 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsta3P23591 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsta3P23591 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms