Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms