Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NelfeP19426 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NelfeP19426 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NelfeP19426 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NelfeP19426 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NelfeP19426 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NelfeP19426 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NelfeP19426 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NelfeP19426 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms