Protein–RNA interactions for Protein: P19001

Krt19, Keratin, type I cytoskeletal 19, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt19P19001 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt19P19001 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt19P19001 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt19P19001 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt19P19001 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt19P19001 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt19P19001 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt19P19001 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt19P19001 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt19P19001 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt19P19001 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt19P19001 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt19P19001 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt19P19001 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt19P19001 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt19P19001 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt19P19001 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt19P19001 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt19P19001 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt19P19001 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt19P19001 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt19P19001 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt19P19001 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt19P19001 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt19P19001 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt19P19001 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt19P19001 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt19P19001 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt19P19001 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt19P19001 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt19P19001 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt19P19001 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt19P19001 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt19P19001 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt19P19001 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt19P19001 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt19P19001 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt19P19001 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt19P19001 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt19P19001 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt19P19001 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt19P19001 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt19P19001 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt19P19001 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt19P19001 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt19P19001 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt19P19001 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt19P19001 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt19P19001 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt19P19001 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt19P19001 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt19P19001 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt19P19001 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt19P19001 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt19P19001 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt19P19001 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt19P19001 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt19P19001 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt19P19001 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt19P19001 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt19P19001 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt19P19001 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt19P19001 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt19P19001 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt19P19001 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt19P19001 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt19P19001 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt19P19001 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt19P19001 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt19P19001 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt19P19001 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt19P19001 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt19P19001 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt19P19001 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt19P19001 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt19P19001 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt19P19001 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt19P19001 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt19P19001 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt19P19001 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt19P19001 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt19P19001 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt19P19001 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt19P19001 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt19P19001 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt19P19001 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt19P19001 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt19P19001 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt19P19001 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt19P19001 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt19P19001 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt19P19001 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt19P19001 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt19P19001 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt19P19001 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt19P19001 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt19P19001 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt19P19001 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Krt19P19001 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Krt19P19001 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms