Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RargP18911 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RargP18911 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RargP18911 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RargP18911 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RargP18911 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RargP18911 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RargP18911 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RargP18911 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RargP18911 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RargP18911 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RargP18911 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RargP18911 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RargP18911 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RargP18911 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RargP18911 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RargP18911 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RargP18911 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RargP18911 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RargP18911 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RargP18911 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RargP18911 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RargP18911 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RargP18911 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RargP18911 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RargP18911 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RargP18911 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RargP18911 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RargP18911 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RargP18911 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RargP18911 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RargP18911 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RargP18911 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RargP18911 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RargP18911 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RargP18911 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RargP18911 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RargP18911 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RargP18911 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RargP18911 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RargP18911 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RargP18911 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RargP18911 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RargP18911 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RargP18911 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RargP18911 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RargP18911 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RargP18911 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RargP18911 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RargP18911 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RargP18911 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RargP18911 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RargP18911 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RargP18911 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RargP18911 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RargP18911 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RargP18911 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RargP18911 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RargP18911 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RargP18911 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RargP18911 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RargP18911 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RargP18911 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RargP18911 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RargP18911 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RargP18911 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RargP18911 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RargP18911 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RargP18911 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RargP18911 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RargP18911 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RargP18911 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RargP18911 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RargP18911 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RargP18911 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RargP18911 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RargP18911 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RargP18911 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RargP18911 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RargP18911 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RargP18911 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RargP18911 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RargP18911 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RargP18911 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RargP18911 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RargP18911 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RargP18911 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RargP18911 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RargP18911 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RargP18911 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RargP18911 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RargP18911 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RargP18911 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RargP18911 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RargP18911 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RargP18911 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RargP18911 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RargP18911 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RargP18911 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RargP18911 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms