Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P18528 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P18528 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P18528 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P18528 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P18528 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P18528 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P18528 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P18528 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
P18528 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P18528 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P18528 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P18528 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
P18528 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P18528 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P18528 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P18528 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
P18528 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
P18528 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P18528 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
P18528 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
P18528 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
P18528 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P18528 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P18528 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18528 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18528 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
P18528 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18528 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18528 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18528 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18528 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18528 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18528 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18528 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18528 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18528 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18528 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18528 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18528 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18528 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18528 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18528 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18528 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18528 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18528 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18528 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18528 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18528 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18528 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18528 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18528 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18528 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18528 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms