Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpraP18052 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpraP18052 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpraP18052 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpraP18052 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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