Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RhoP15409 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RhoP15409 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RhoP15409 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RhoP15409 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RhoP15409 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RhoP15409 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RhoP15409 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RhoP15409 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RhoP15409 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RhoP15409 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RhoP15409 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RhoP15409 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RhoP15409 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RhoP15409 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RhoP15409 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RhoP15409 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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RhoP15409 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RhoP15409 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RhoP15409 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RhoP15409 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RhoP15409 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RhoP15409 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RhoP15409 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RhoP15409 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RhoP15409 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RhoP15409 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RhoP15409 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RhoP15409 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RhoP15409 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RhoP15409 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RhoP15409 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RhoP15409 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RhoP15409 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RhoP15409 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RhoP15409 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RhoP15409 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RhoP15409 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RhoP15409 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RhoP15409 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RhoP15409 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RhoP15409 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RhoP15409 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RhoP15409 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RhoP15409 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RhoP15409 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RhoP15409 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RhoP15409 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RhoP15409 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RhoP15409 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RhoP15409 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RhoP15409 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RhoP15409 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RhoP15409 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RhoP15409 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RhoP15409 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RhoP15409 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RhoP15409 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RhoP15409 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RhoP15409 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RhoP15409 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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