Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrphP15331 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrphP15331 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PrphP15331 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrphP15331 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrphP15331 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrphP15331 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrphP15331 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrphP15331 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PrphP15331 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrphP15331 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrphP15331 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PrphP15331 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrphP15331 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrphP15331 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrphP15331 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrphP15331 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrphP15331 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrphP15331 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrphP15331 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrphP15331 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrphP15331 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrphP15331 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrphP15331 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrphP15331 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrphP15331 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrphP15331 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrphP15331 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrphP15331 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrphP15331 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrphP15331 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrphP15331 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrphP15331 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrphP15331 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrphP15331 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrphP15331 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrphP15331 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrphP15331 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrphP15331 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrphP15331 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrphP15331 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrphP15331 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrphP15331 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PrphP15331 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrphP15331 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PrphP15331 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrphP15331 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrphP15331 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrphP15331 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrphP15331 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrphP15331 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrphP15331 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrphP15331 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrphP15331 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrphP15331 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrphP15331 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrphP15331 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms