Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Irf1P15314 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Irf1P15314 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Irf1P15314 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Irf1P15314 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Irf1P15314 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Irf1P15314 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Irf1P15314 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Irf1P15314 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Irf1P15314 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Irf1P15314 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Irf1P15314 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Irf1P15314 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Irf1P15314 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Irf1P15314 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Irf1P15314 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Irf1P15314 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Irf1P15314 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Irf1P15314 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Irf1P15314 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Irf1P15314 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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