Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms