Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp1P11438 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms