Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PolP11369 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PolP11369 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PolP11369 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PolP11369 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PolP11369 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PolP11369 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PolP11369 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PolP11369 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PolP11369 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PolP11369 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PolP11369 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PolP11369 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PolP11369 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PolP11369 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PolP11369 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PolP11369 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PolP11369 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PolP11369 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PolP11369 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PolP11369 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PolP11369 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PolP11369 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PolP11369 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms