Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms