Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
P10404 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
P10404 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
P10404 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P10404 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
P10404 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P10404 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P10404 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P10404 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P10404 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
P10404 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P10404 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P10404 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P10404 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
P10404 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
P10404 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
P10404 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
P10404 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
P10404 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
P10404 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
P10404 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
P10404 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
P10404 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
P10404 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
P10404 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
P10404 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
P10404 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
P10404 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
P10404 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
P10404 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
P10404 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
P10404 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
P10404 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
P10404 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
P10404 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
P10404 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
P10404 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
P10404 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
P10404 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
P10404 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
P10404 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
P10404 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
P10404 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
P10404 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
P10404 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
P10404 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
P10404 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
P10404 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
P10404 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
P10404 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms