Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PolP10400 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PolP10400 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PolP10400 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PolP10400 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PolP10400 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PolP10400 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PolP10400 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PolP10400 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PolP10400 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PolP10400 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PolP10400 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PolP10400 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PolP10400 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PolP10400 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PolP10400 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PolP10400 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PolP10400 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PolP10400 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PolP10400 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PolP10400 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PolP10400 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PolP10400 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PolP10400 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PolP10400 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PolP10400 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PolP10400 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PolP10400 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PolP10400 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PolP10400 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PolP10400 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PolP10400 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PolP10400 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PolP10400 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PolP10400 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PolP10400 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PolP10400 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PolP10400 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PolP10400 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PolP10400 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PolP10400 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PolP10400 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PolP10400 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PolP10400 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PolP10400 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PolP10400 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PolP10400 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PolP10400 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PolP10400 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PolP10400 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PolP10400 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PolP10400 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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