Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnfP06804 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnfP06804 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnfP06804 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnfP06804 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnfP06804 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnfP06804 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnfP06804 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnfP06804 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnfP06804 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnfP06804 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnfP06804 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnfP06804 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnfP06804 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnfP06804 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnfP06804 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnfP06804 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnfP06804 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnfP06804 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnfP06804 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnfP06804 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnfP06804 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnfP06804 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnfP06804 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnfP06804 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TnfP06804 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnfP06804 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnfP06804 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnfP06804 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnfP06804 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnfP06804 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnfP06804 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TnfP06804 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TnfP06804 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TnfP06804 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TnfP06804 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TnfP06804 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TnfP06804 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TnfP06804 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TnfP06804 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TnfP06804 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TnfP06804 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TnfP06804 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TnfP06804 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TnfP06804 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TnfP06804 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TnfP06804 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TnfP06804 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TnfP06804 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TnfP06804 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TnfP06804 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TnfP06804 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TnfP06804 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TnfP06804 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TnfP06804 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnfP06804 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnfP06804 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnfP06804 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnfP06804 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnfP06804 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnfP06804 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnfP06804 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TnfP06804 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TnfP06804 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnfP06804 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnfP06804 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnfP06804 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnfP06804 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnfP06804 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnfP06804 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnfP06804 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnfP06804 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnfP06804 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnfP06804 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnfP06804 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnfP06804 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnfP06804 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnfP06804 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnfP06804 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnfP06804 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnfP06804 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnfP06804 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnfP06804 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnfP06804 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnfP06804 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnfP06804 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnfP06804 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnfP06804 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnfP06804 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnfP06804 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnfP06804 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnfP06804 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnfP06804 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnfP06804 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnfP06804 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnfP06804 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnfP06804 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnfP06804 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnfP06804 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TnfP06804 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms