Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P06323 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P06323 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P06323 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P06323 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P06323 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P06323 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P06323 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P06323 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P06323 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06323 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06323 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06323 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06323 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06323 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06323 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06323 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06323 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06323 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P06323 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06323 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06323 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06323 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06323 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06323 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06323 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06323 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06323 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06323 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06323 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06323 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms