Protein–RNA interactions for Protein: P01823

Ig heavy chain V region 36-60, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01823 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P01823 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P01823 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P01823 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P01823 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P01823 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P01823 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P01823 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P01823 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P01823 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P01823 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P01823 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P01823 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P01823 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P01823 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P01823 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P01823 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P01823 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P01823 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P01823 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P01823 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P01823 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P01823 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P01823 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P01823 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P01823 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P01823 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P01823 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P01823 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P01823 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01823 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01823 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01823 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01823 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01823 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01823 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01823 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01823 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01823 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01823 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01823 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01823 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P01823 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms