Protein–RNA interactions for Protein: P01647

Ig kappa chain V-V region HP 124E1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01647 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01647 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01647 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01647 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01647 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01647 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01647 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01647 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01647 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01647 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01647 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01647 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01647 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01647 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01647 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01647 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01647 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01647 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01647 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01647 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01647 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01647 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01647 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01647 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01647 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01647 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01647 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01647 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01647 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01647 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01647 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01647 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01647 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01647 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01647 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01647 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01647 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01647 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01647 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01647 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01647 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms