Protein–RNA interactions for Protein: P01644

Ig kappa chain V-V region HP R16.7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01644 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01644 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01644 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01644 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01644 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01644 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01644 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01644 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01644 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01644 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01644 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01644 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01644 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01644 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01644 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01644 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01644 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01644 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01644 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01644 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms