Protein–RNA interactions for Protein: O89116

Vti1a, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1aO89116 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms