Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Ccl20O89093 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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