Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CopeO89079 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CopeO89079 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CopeO89079 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CopeO89079 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CopeO89079 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CopeO89079 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CopeO89079 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CopeO89079 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CopeO89079 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CopeO89079 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CopeO89079 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CopeO89079 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CopeO89079 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CopeO89079 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CopeO89079 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CopeO89079 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CopeO89079 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CopeO89079 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CopeO89079 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CopeO89079 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CopeO89079 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CopeO89079 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CopeO89079 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CopeO89079 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CopeO89079 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CopeO89079 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CopeO89079 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CopeO89079 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CopeO89079 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CopeO89079 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CopeO89079 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CopeO89079 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CopeO89079 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CopeO89079 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CopeO89079 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CopeO89079 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CopeO89079 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CopeO89079 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CopeO89079 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CopeO89079 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CopeO89079 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CopeO89079 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CopeO89079 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CopeO89079 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CopeO89079 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CopeO89079 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CopeO89079 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CopeO89079 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CopeO89079 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CopeO89079 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CopeO89079 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CopeO89079 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CopeO89079 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CopeO89079 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CopeO89079 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CopeO89079 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CopeO89079 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CopeO89079 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CopeO89079 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CopeO89079 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CopeO89079 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CopeO89079 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CopeO89079 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CopeO89079 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CopeO89079 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CopeO89079 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CopeO89079 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CopeO89079 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CopeO89079 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CopeO89079 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CopeO89079 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CopeO89079 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CopeO89079 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CopeO89079 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CopeO89079 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CopeO89079 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CopeO89079 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CopeO89079 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CopeO89079 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CopeO89079 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CopeO89079 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CopeO89079 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CopeO89079 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CopeO89079 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CopeO89079 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CopeO89079 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CopeO89079 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CopeO89079 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CopeO89079 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CopeO89079 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CopeO89079 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CopeO89079 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CopeO89079 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CopeO89079 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CopeO89079 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CopeO89079 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CopeO89079 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CopeO89079 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CopeO89079 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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