Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

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Length 779 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Hcn3O88705 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Hcn3O88705 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Hcn3O88705 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Hcn3O88705 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hcn3O88705 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hcn3O88705 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hcn3O88705 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Hcn3O88705 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Hcn3O88705 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn3O88705 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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