Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms