Protein–RNA interactions for Protein: O54910

Nfkbie, NF-kappa-B inhibitor epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbieO54910 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms