Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops5O35864 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops5O35864 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cops5O35864 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cops5O35864 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cops5O35864 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cops5O35864 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cops5O35864 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cops5O35864 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cops5O35864 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms