Protein–RNA interactions for Protein: O35595

Ptch2, Protein patched homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch2O35595 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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