Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk2O35491 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk2O35491 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk2O35491 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk2O35491 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk2O35491 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk2O35491 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk2O35491 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Clk2O35491 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk2O35491 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Clk2O35491 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Clk2O35491 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk2O35491 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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