Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms