Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms