Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Abcc1O35379 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
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Abcc1O35379 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Abcc1O35379 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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Abcc1O35379 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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Abcc1O35379 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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Abcc1O35379 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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Abcc1O35379 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Abcc1O35379 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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