Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc18a3O35304 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms